<div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi Borries and colleagues,<div>Thank you for your last emails and for the very interesting results. And sorry for my late reply, things are very busy here... I´ll write a longer email with some comments later this week. </div><div>Best regards,</div><div>AnaG</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Em ter., 9 de jun. de 2020 às 23:27, Borries Demeler <<a href="mailto:demeler@gmail.com">demeler@gmail.com</a>> escreveu:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><br>
Bruno and Ana,<br>
do you have some comments on what we should attempt here for our paper?<br>
In any case, let's wait until Bruno can send some more samples to ship<br>
here. Then we should attempt the SDS experiments and start by comparing <br>
differences coming from the SDS contacts with the protein. I think that <br>
would already be quite interesting. The protein dynamics may be<br>
interesting if there is reduction in dynamics upon dimerization and we<br>
could see that. It sounds like we can get a lot of details already<br>
without the full assignments. Hence, I really believe this could be<br>
worthwhile.<br>
Thanks a lot, Paul! Looking forward to the SDS data...<br>
<br>
Best wishes to all, and stay safe whereever you are!<br>
<br>
-Borries<br>
<br>
On Mon, Jun 08, 2020 at 08:40:15PM +0000, Hazendonk, Paul wrote:<br>
> The DOSY data of the protein and mixtures should shed some light in its size and degree of association with the SDS.<br>
> <br>
> Without doing a complete assignment we can probably identify what type AAs are involved with interactions with SDS through changes in there shifts.  However we cannot be unambiguous about which one in particular it is in the sequence.<br>
> <br>
> Relaxation  times of the H-alpha will give use some insights into changes in ptn dynamics. The NH signal can tell us about the motion in the alpha helical regions. The buried methyl signals can tell us about  the hydrophobic regions.<br>
> <br>
> Any ambiguities would be lifted with a full assignment, however a worthwhile endeavor, will take a lot of time.<br>
> <br>
> Sent from Outlook Mobile<<a href="https://aka.ms/blhgte" rel="noreferrer" target="_blank">https://aka.ms/blhgte</a>><br>
> <br>
<br>
> _______________________________________________<br>
> Myotox mailing list<br>
> <a href="mailto:Myotox@biophysics.uleth.ca" target="_blank">Myotox@biophysics.uleth.ca</a><br>
> <a href="http://demeler7.uleth.ca/mailman/listinfo/myotox" rel="noreferrer" target="_blank">http://demeler7.uleth.ca/mailman/listinfo/myotox</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Myotox mailing list<br>
<a href="mailto:Myotox@biophysics.uleth.ca" target="_blank">Myotox@biophysics.uleth.ca</a><br>
<a href="http://demeler7.uleth.ca/mailman/listinfo/myotox" rel="noreferrer" target="_blank">http://demeler7.uleth.ca/mailman/listinfo/myotox</a><br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><span style="color:rgb(11,83,148);font-family:tahoma,sans-serif;font-size:x-small">Ana Gisele da C. Neves Ferreira</span><br></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">Pesquisadora Titular em Saúde Pública</font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">Chefe do Laboratorio de Toxinologia</font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">Instituto Oswaldo Cruz - Fiocruz</font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">Pavilhao Ozorio de Almeida, sala 05</font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">Av. Brasil, 4365 - Manguinhos</font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">Rio de Janeiro - RJ </font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">21040-900 Brasil</font></div><div><font style="background-color:rgb(255,255,255)" face="tahoma, sans-serif" color="#0b5394" size="1">(+5521) 2562-1381 / 98801-5726</font></div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><font size="1" color="#666666" face="tahoma, sans-serif"><br><br><br></font></div></div></div></div></div></div></div></div>