
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>

</head>

<body dir="ltr">

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">

Hello,</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">

<br>

</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">

Just to clarify the SDS concentration was 1%(w/v). <br>

</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">

<br>

</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">

Cheers, <br>

</div>

<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:12pt; color:rgb(0,0,0)">

Amy Henrickson <br>

</div>

<div id="appendonsend"></div>

<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">

<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font style="font-size:11pt" face="Calibri, sans-serif" color="#000000"><b>From:</b> Myotox <myotox-bounces@biophysics.uleth.ca> on behalf of Borries Demeler <demeler@gmail.com><br>

<b>Sent:</b> Thursday, March 12, 2020 2:45 PM<br>

<b>To:</b> myotox@biophysics.uleth.ca <myotox@biophysics.uleth.ca><br>

<b>Subject:</b> [Myotox] SDS AUC update</font>

<div> </div>

</div>

<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:11pt">

<div class="PlainText">Dear all,<br>

Amy ran the most recent samples from Bruno in the presence of 1 mg/ml<br>

SDS at two protein concentrations (1 mg/ml and 0.17 mg/ml). The results<br>

are quite consistent with the results in Susumu's paper. We do see<br>

oligomerization, with a more or less final state. At this point I am not<br>

clear if it is a dimer or trimer or something higher, this still needs<br>

to be determined. But it is very clear that SDS has a big effect on<br>

dimerization. What also is interesting is that the association behavior<br>

induced by SDS appears to be reversible. That is, you get dissociation<br>

of the oligomer in response to lowering the concentration. We will<br>

further test this by using even lower concentration to see if we can<br>

shift to entirely monomer. We will also do D2O density matching to see<br>

if there is a density difference between monomer and dimer and<br>

potentially higher oligomers due to different ratios of SDS binding to<br>

myotoxin-II.<br>

<br>

Now we need to come up with a strutural explanation why this<br>

oligomerization shift is happening in response to addition of SDS. I<br>

would also like to know if some other lipids could cause the same effect<br>

as a detergent? A figure is attached that shows the sedimentation<br>

distribution, it looks like similar values as those obtained for the<br>

different toxin in the Uchiyama paper.<br>

<br>

Regards, -Borries<br>

<br>

<br>

</div>

</span></font></div>

</body>

</html>